Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Eif3fQ9DCH4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eif3fQ9DCH4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.1 ms