Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt112Q9DCG9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt112Q9DCG9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt112Q9DCG9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms