Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne8Q9DC53 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne8Q9DC53 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne8Q9DC53 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne8Q9DC53 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne8Q9DC53 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne8Q9DC53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cpne8Q9DC53 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cpne8Q9DC53 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cpne8Q9DC53 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cpne8Q9DC53 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms