Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smg9Q9DB90 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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