Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ap1s2Q9DB50 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap1s2Q9DB50 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ap1s2Q9DB50 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms