Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pop5Q9DB28 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pop5Q9DB28 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pop5Q9DB28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms