Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc54Q9DAL3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc54Q9DAL3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc54Q9DAL3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms