Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ccdc89Q9DA73 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ccdc89Q9DA73 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc89Q9DA73 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc89Q9DA73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms