Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smco2Q9DA21 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smco2Q9DA21 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms