Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pdzd9Q9D9M4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdzd9Q9D9M4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdzd9Q9D9M4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdzd9Q9D9M4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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