Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C7

Uncharacterized protein C3orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9C7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D9C7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D9C7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D9C7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D9C7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D9C7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D9C7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q9D9C7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D9C7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9C7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D9C7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms