Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Snx5Q9D8U8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Snx5Q9D8U8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Snx5Q9D8U8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms