Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rexo2Q9D8S4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rexo2Q9D8S4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rexo2Q9D8S4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms