Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufb8Q9D6J5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ndufb8Q9D6J5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.4 ms