Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pfn4Q9D6I3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pfn4Q9D6I3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pfn4Q9D6I3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms