Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt34Q9D646 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt34Q9D646 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt34Q9D646 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms