Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc81Q9D5W4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc81Q9D5W4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms