Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
4931428L18RikQ9D4S9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
4931428L18RikQ9D4S9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931428L18RikQ9D4S9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms