Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930564D02RikQ9D4S4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms