Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syce1Q9D495 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syce1Q9D495 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syce1Q9D495 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms