Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D454 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D454 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D454 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D454 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D454 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9D454 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D454 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D454 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D454 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D454 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9D454 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Q9D454 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D454 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D454 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D454 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D454 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Q9D454 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D454 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D454 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D454 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9D454 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D454 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9D454 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D454 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D454 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Q9D454 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D454 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D454 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9D454 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D454 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D454 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D454 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D454 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D454 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9D454 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D454 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D454 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D454 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D454 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D454 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D454 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D454 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D454 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D454 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D454 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D454 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D454 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D454 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D454 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D454 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D454 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms