Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W5

Lrrc71, Leucine-rich repeat-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc71Q9D3W5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrrc71Q9D3W5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrrc71Q9D3W5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrrc71Q9D3W5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms