Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2P4

Urm1, Ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urm1Q9D2P4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Urm1Q9D2P4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Urm1Q9D2P4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Urm1Q9D2P4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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