Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps33aQ9D2N9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps33aQ9D2N9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps33aQ9D2N9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.7 ms