Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Y9

Shisal2b, Protein shisa-like-2B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2bQ9D1Y9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Shisal2bQ9D1Y9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Shisal2bQ9D1Y9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Shisal2bQ9D1Y9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms