Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rtl8bQ9D1F0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rtl8bQ9D1F0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms