Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lmbr1lQ9D1E5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmbr1lQ9D1E5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Lmbr1lQ9D1E5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms