Protein–RNA interactions for Protein: Q9D180

Cfap57, Cilia- and flagella-associated protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap57Q9D180 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfap57Q9D180 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap57Q9D180 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap57Q9D180 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms