Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gtf2e1Q9D0D5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gtf2e1Q9D0D5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gtf2e1Q9D0D5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms