Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Spc24Q9D083 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Spc24Q9D083 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Spc24Q9D083 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms