Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc47Q9D024 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc47Q9D024 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc47Q9D024 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc47Q9D024 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms