Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem39aQ9CYC3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmem39aQ9CYC3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmem39aQ9CYC3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms