Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ssu72Q9CY97 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssu72Q9CY97 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssu72Q9CY97 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssu72Q9CY97 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssu72Q9CY97 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssu72Q9CY97 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ssu72Q9CY97 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ssu72Q9CY97 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ssu72Q9CY97 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms