Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY73

Mrpl44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl44Q9CY73 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrpl44Q9CY73 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mrpl44Q9CY73 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mrpl44Q9CY73 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Mrpl44Q9CY73 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Mrpl44Q9CY73 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mrpl44Q9CY73 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mrpl44Q9CY73 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms