Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mis12Q9CY25 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mis12Q9CY25 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mis12Q9CY25 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms