Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RpainQ9CWY9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RpainQ9CWY9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RpainQ9CWY9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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