Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NubplQ9CWD8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NubplQ9CWD8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NubplQ9CWD8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms