Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms