Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
4930524J08RikQ9CUJ5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms