Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
4930535I16RikQ9CUI2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
4930535I16RikQ9CUI2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
4930535I16RikQ9CUI2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms