Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q9CRW3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9CRW3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9CRW3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9CRW3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms