Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tm7sf3Q9CRG1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Tm7sf3Q9CRG1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tm7sf3Q9CRG1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms