Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR96

Tmem208, Transmembrane protein 208, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem208Q9CR96 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem208Q9CR96 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmem208Q9CR96 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tmem208Q9CR96 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Tmem208Q9CR96 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Tmem208Q9CR96 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tmem208Q9CR96 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem208Q9CR96 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms