Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ska2Q9CR46 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ska2Q9CR46 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ska2Q9CR46 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms