Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Klhl28Q9CR40 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl28Q9CR40 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl28Q9CR40 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms