Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tm4sf20Q9CQY8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Tm4sf20Q9CQY8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tm4sf20Q9CQY8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tm4sf20Q9CQY8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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