Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg12Q9CQY1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg12Q9CQY1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg12Q9CQY1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms