Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufb9Q9CQJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufb9Q9CQJ8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufb9Q9CQJ8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufb9Q9CQJ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms