Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms