Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed6Q9CQG0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tmed6Q9CQG0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms